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Enregistrement W2042911713 · doi:10.1107/s0907444900010040

The purification, crystallization and preliminary structural characterization of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (RmlA), the first enzyme of the dTDP-<scp>L</scp>-rhamnose synthesis pathway from<i>Pseudomonas aeruginosa</i>

2000· article· en· W2042911713 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section D Biological Crystallography · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueEnzyme Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCrystallizationRhamnoseBiosynthesisEnzymeChemistryBacteriaMonomerBiochemistryDe novo synthesisStereochemistryBiologyGalactoseOrganic chemistryPolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (RmlA; E.C. 2.7.7.24) is the first of four enzymes involved in the biosynthesis of dTDP-L-rhamnose, the precursor of L-rhamnose, a key component of the cell wall of many pathogenic bacteria. RmlA catalyses the condensation of thymidine triphosphate (dTTP) and alpha-D-glucose-1-phosphate (G1P), yielding dTDP-D-glucose. RmlA from Pseudomonas aeruginosa has been overexpressed and purified. Crystals of the enzyme have been grown using the sitting-drop vapour-diffusion technique with PEG 6000 and lithium sulfate as precipitant. Several diffraction data sets of single frozen crystals were collected to a resolution of 1.66 A. Crystals belonged to space group P1, with unit-cell parameters a = 71.5, b = 73.1, c = 134.7 A, alpha = 89.9, beta = 80.9, gamma = 81.1 degrees. The asymmetric unit contains eight monomers in the form of two RmlA tetramers with a solvent content of 51%. Selenomethionine-labelled protein has been obtained and crystallized.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,702
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle