Pectobacterium aroidearum sp. nov., a soft rot pathogen with preference for monocotyledonous plants
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Several pectolytic bacterial strains, mainly isolated from monocotyledonous plants and previously identified as Pectobacterium carotovorum, were thought to belong to a novel species after several taxonomic analyses including DNA-DNA hybridization. In 16S rRNA gene sequence analyses, these strains had a similarity of >97.9 % to the 16S rRNA gene sequence of strains representing six other pectobacterial species and subspecies. These strains, represented by strain SCRI 109(T), also showed some unique chemotaxonomic features and quantitative differences in polar lipids, lipoquinones and fatty acids. A specific feature of strain SCRI 109(T) was the presence of DMK-8 lipoquinone, while the dominant fatty acids were the summed feature 3 (iso-C15 : 0 2-OH/C16 : 1ω7c), the unsaturated fatty acid C18 : 1ω7c and straight chain fatty acids, mainly C16 : 0. The DNA G+C content of strain SCRI 109(T) was 50.2 mol%. The taxonomic status of strain SCRI 109(T) and related strains in 16S rRNA gene sequence, chemotaxonomic, and physiological analyses was corroborated by the distinct clustering of these strains in multi-locus sequence analyses. It is proposed that these strains represent a novel species for which the name Pectobacterium aroidearum sp. nov. is proposed; the type strain is SCRI 109(T) ( = NCPPB 929(T) = LMG 2417(T) = ICMP 1522(T)).
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle