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Enregistrement W2043073239 · doi:10.1016/j.jalz.2014.05.1756

The EADC‐ADNI Harmonized Protocol for manual hippocampal segmentation on magnetic resonance: Evidence of validity

2014· article· en· W2043073239 sur OpenAlexafffund
Giovanni B. Frisoni, Clifford R. Jack, Martina Bocchetta, Corinna M. Bauer, Kristian Steen Frederiksen, Yawu Liu, Gregory M. Preboske, Tim Swihart, Melanie Blair, Enrica Cavedo, Michel J. Grothe, Mariangela Lanfredi, Oliver Martinez, Masami Nishikawa, Marileen Portegies, Travis Stoub, Chadwich Ward, Liana G. Apostolova, Rossana Ganzola, Dominik Wolf‎, Frederik Barkhof, George Bartzokis, Charles DeCarli, John G. Csernansky, Leyla deToledo‐Morrell, Mirjam I. Geerlings, Jeffrey Kaye, Ronald Killiany, Stéphane Lehéricy, Hiroshi Matsuda, John T. O’Brien, Lisa C. Silbert, Philip Scheltens, Hilkka Soininen, Stefan Teipel, Gunhild Waldemar, Andreas Fellgiebel, Josephine Barnes, Michael Firbank, Lotte Gerritsen, Wouter J.P. Henneman, Nikolai Malykhin, Jens C. Pruessner, Lei Wang, Craig Watson, Henrike Wolf, Mony J. de Leon, Johannes Pantel, Clarissa Ferrari, Paolo Bosco, Patrizio Pasqualetti, Simon Duchesne, Henri M. Duvernoy, Marina Boccardi, Marilyn S. Albert, David Bennet, Richard Camicioli, D. Louis Collins, Bruno Dubois, Harald Hampel, Tom denHeijer, Christofer Hock, William J. Jagust, Leonore J. Launer, Jerome J. Maller, S. G. Mueller, Perminder S. Sachdev, Andy Simmons, Paul M. Thompson, Peter‐Jelle Visser, Lars‐Olof Wahlund, Michael W. Weiner, Bengt Winblad

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensUniversity of AlbertaUniversité LavalMcGill UniversityInstitut Universitaire en Santé Mentale de Québec
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingUniversity of California, San FranciscoUniversity of California, San DiegoNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, Los AngelesNational Institutes of HealthInnogeneticsServierKuopion Yliopistollinen SairaalaEisaiAgence Nationale de la RechercheBayer HealthCareKing's College LondonNorthern California Institute for Research and EducationRush UniversityJohns Hopkins UniversityDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenUniversité LavalPfizerNorthwestern UniversityBioClinicaUniversity of AlbertaSchool of Medicine, Boston UniversityGE HealthcareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeMeso Scale DiagnosticsSynarcMcGill UniversityRocheUniversity of Southern CaliforniaAbbott FundBristol-Myers SquibbEli Lilly and CompanyBrain Research TrustAstraZenecaNovartis Pharmaceuticals CorporationTakeda Pharmaceutical CompanyMedpaceBiogen IdecAlzheimer's AssociationAmorfix Life SciencesKarolinska InstitutetAlzheimer's Drug Discovery FoundationMerck
Mots-clésHARPSegmentationProtocol (science)NeuroimagingNuclear medicineMagnetic resonance imagingDiffusion MRIMedicinePsychologyComputer scienceArtificial intelligenceRadiologyPathologyPhysicsPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: An international Delphi panel has defined a harmonized protocol (HarP) for the manual segmentation of the hippocampus on MR. The aim of this study is to study the concurrent validity of the HarP toward local protocols, and its major sources of variance. METHODS: Fourteen tracers segmented 10 Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) cases scanned at 1.5 T and 3T following local protocols, qualified for segmentation based on the HarP through a standard web-platform and resegmented following the HarP. The five most accurate tracers followed the HarP to segment 15 ADNI cases acquired at three time points on both 1.5 T and 3T. RESULTS: The agreement among tracers was relatively low with the local protocols (absolute left/right ICC 0.44/0.43) and much higher with the HarP (absolute left/right ICC 0.88/0.89). On the larger set of 15 cases, the HarP agreement within (left/right ICC range: 0.94/0.95 to 0.99/0.99) and among tracers (left/right ICC range: 0.89/0.90) was very high. The volume variance due to different tracers was 0.9% of the total, comparing favorably to variance due to scanner manufacturer (1.2), atrophy rates (3.5), hemispheric asymmetry (3.7), field strength (4.4), and significantly smaller than the variance due to atrophy (33.5%, P < .001), and physiological variability (49.2%, P < .001). CONCLUSIONS: The HarP has high measurement stability compared with local segmentation protocols, and good reproducibility within and among human tracers. Hippocampi segmented with the HarP can be used as a reference for the qualification of human tracers and automated segmentation algorithms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,374
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,379
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,374
Score d'incertitude au seuil0,772

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3740,379
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0030,006
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0040,007
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,307 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations206
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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