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Enregistrement W2043135161 · doi:10.1039/b200897a

Achieving photo-control of protein conformation and activity: producing a photo-controlled leucine zipper

2002· article· en· W2043135161 sur OpenAlex
Janet R. Kumita, Daniel G. Flint, G. Andrew Woolley, Oliver S. Smart

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueFaraday Discussions · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAzobenzenePeptideCoiled coilLeucine zipperChemistryCysteineMoietyHelix (gastropod)Conformational changeLinkerStereochemistryBiophysicsPeptide sequenceBiochemistryMoleculeOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have recently developed a technique that has great potential in producing proteins with photo-control of conformation and consequently activity (J. R. Kumita, O. S. Smart and G. A. Woolley, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2000, 97, 3803-3808). The method is based on incorporating two cysteine residues into the sequence of a polypeptide. An azobenzene derivative is subsequently used to produce an intramolecular cross-link between the cysteine sulfhydryl groups. In previous work photo-isomerisation of the azobenzene moiety has been used to control the helicity of a monomeric peptide. In the experiments described here this method has been applied to the coiled coil leucine zipper peptide GCN4-p1. The aim was to produce a variant of GCN4-p1 whose helicity and consequently dimerisation is under direct photo-control. We have produced a modified GCN4-p1 incorporating two cysteine residues. The mutations introduced are shown to interfere with the ability of the uncross-linked peptide to form a coiled coil. After the peptide was cross-linked with the azobenzene derivative more normal coiled-coil behaviour was restored. Irradiation of the peptide producing a conformational change in the azobenzene cross-linker was accompanied by an increase in the helicity of the peptide. The work presented here highlights the potential of the use of photo-isomerisable cross-linkers to control protein activity through induced conformational change. In addition, the methodology has the potential to provide a fast trigger for the initiation of protein conformational changes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle