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Enregistrement W2043249485 · doi:10.1007/s12284-008-9019-2

Molecular and Evolutionary Analysis of the Hd6 Photoperiod Sensitivity Gene Within Genus Oryza

2008· article· en· W2043249485 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueRice · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsMinistry of Agriculture, Forestry and Fisheries
Mots-clésBiologyNonsynonymous substitutionGeneGeneticsJaponicaOryzaOryza sativaPhylogenetic treeLocus (genetics)Evolutionary biologyGenomeBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Heading date determines rice’s adaptation to its area and cropping season. We analyzed the molecular evolution of the Hd6 quantitative trait locus for photoperiod sensitivity in a total of 20 cultivated varieties and wild rice species and found 74 polymorphic sites within its coding region (1,002 bp), of which five were nonsynonymous substitutions. Thus, natural mutations and modifications of the coding region of Hd6 within the genus Oryza have been suppressed during its evolution; this is supported by low Ka (≤0.003) and Ka/Ks (≤0.576) values between species, indicating purifying selection for a protein-coding gene. A nonsynonymous substitution detected in the japonica variety “Nipponbare” (a premature stop codon and nonfunctional allele) was found within only some local Japanese japonica varieties, which suggests that this point mutation happened recently, probably after the introduction of Chinese rice to Japan, and is likely involved in rice adaptation to high latitudes. Phylogenetic analysis and genome divergence using the entire Hd6 genomic region confirmed the current taxonomic sections of Oryza and supported the hypothesis of independent domestication of indica and japonica rice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,588
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle