MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2043258776 · doi:10.1021/la030193e

Divalent Calcium Ions Inhibit the Penetration of Protamine through the Polysaccharide Brush of the Outer Membrane of Gram-Negative Bacteria

2003· article· en· W2043258776 sur OpenAlexaff
David A. Pink, Lisbeth Truelstrup Hansen, Tom Gill, Bonnie Quinn, M. H. Jericho, Terry J. Beveridge

Notice bibliographique

RevueLangmuir · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of GuelphSt. Francis Xavier UniversityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProtamineChemistryDivalentCalciumMembraneMoleculeLiposomeBiophysicsBiochemistryHeparinOrganic chemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Protamine is a cationic antimicrobial peptide, which inhibits or kills a number of Gram-negative bacteria, including Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli . Electrostatic interactions between the outer leaflet of the membrane and protamine are thought to be important for the antimicrobial effect. We hypothesized that divalent ions would compete with protamine for binding to the charged O-sidechain of the liposaccharide and expel protamine from the O-sidechains. Experimentally it was shown that increasing concentrations of divalent cations (Ca 2+ and Mg 2+ ) reduced the antimicrobial effect of protamine on P. aeruginosa PA01 and E. coli . We also modeled the electrostatic interactions between five protamine Y1 molecules from Atlantic herring and the surface of a Gram-negative bacterium possessing charged O-sidechains of the B-band lipopolysaccharides of P. aeruginosa PA01 in the presence/absence of calcium ions in an aqueous solution described by linearized Poisson−Boltzmann theory with Debye screening lengths κ - 1 of 1.0 nm (∼100 mM) and 3.33 nm (∼10 mM). Our conclusions are as follows. [1] A high concentration of calcium ions brought about a slight polysaccharide chain collapse. The calcium ions formed dynamic bridges between the negatively charged O-sidechains on time scales comparable to that of polymer motion. [2] Without the presence of added calcium, all five protamine molecules were trapped in the charged polysaccharide O-sidechain. The probability of finding segments of protamine molecules closer than ∼0.5 nm to the membrane plane (the x − y plane at z = 0) was effectively zero. [3] Both the calcium distribution and the protamine distribution, when present separately, were essentially independent of monovalent ionic concentration for both values of κ. [4] When calcium and protamine were present simultaneously, the effects depended strongly upon the monovalent ion concentration. Added calcium effectively prevented protamine from entering the O-sidechain brush. Conclusions 3 and 4 show that the minimum inhibitory concentration should depend on monovalent ion concentration since complex growth media contain multivalent ions. [5] Our experiments confirmed our theoretical prediction that the addition of Ca 2+ significantly reduced the inhibitory effect of protamine. This also confirmed the importance of electrostatic interactions during the first step in protamine's antibacterial mode of action.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,258

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLangmuirMême sujetAntimicrobial Peptides and ActivitiesTravaux en français237 207