Increased Reporting of Detectable Plasma HIV-1 RNA Levels at the Critical Threshold of 50 Copies per Milliliter With the Taqman Assay in Comparison to the Amplicor Assay
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To investigate the application of the new COBAS Ampliprep Taqman HIV-1 assay in comparison with the COBAS HIV-1 Ampliprep AMPLICOR MONITOR ultrasensitive assay version 1.5, with a particular focus on the most clinically relevant region near the lower limit of quantification. METHODS: Scatterplots and the Bland-Altman plot were used to inspect the degree of agreement between the 2 assays when tested on samples from the British Columbia Centre for Excellence in HIV/AIDS monitoring and evaluation system. Consistency of clinically applicable values at low HIV-1 RNA copy number was assessed from samples from individuals with previously undetectable Amplicor results. RESULTS: Despite general agreement of these assays over a wide dynamic range, the Taqman assay resulted in a nearly 2-fold increase (from 3.6% to 6.9%) in the number of patients experiencing a plasma HIV-1 RNA level >50 copies per milliliter after being suppressed to levels <50 copies per milliliter consistently during the previous year (P < 0.01). In addition, rare discrepancies between the 2 assays were observed to be as high as 0.7 log10 copies per milliliter. The kappa statistic was 0.19, indicating only slight agreement at the critical threshold of 50 HIV RNA copies per milliliter, with 43% of undetectable samples in the Amplicor assay testing detectable in the Taqman assay (median 70 copies/mL; interquartile range 60-83 copies/mL). CONCLUSIONS: The increased frequency of detectable plasma HIV-1 RNA levels at the threshold of 50 copies per milliliter with the new Taqman assay has important implications for highly active antiretroviral therapy monitoring. Until there is clinical evidence that patients with detectable HIV by the Taqman assay (but undetectable HIV with Amplicor) have differential outcomes, it is unclear whether the Taqman assay is appropriate for routine management of HIV-1 therapy, and caution is required in the interpretation of low-level viremia by the Taqman assay until a clinical validation of a new cutoff is performed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,032 | 0,063 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».