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Enregistrement W2043424749 · doi:10.1002/elps.200900306

Analysis of genetic variation in <i>Globocephaloides</i> populations from macropodid marsupials using a mutation scanning‐based approach

2009· article· en· W2043424749 sur OpenAlexaff
Inês P. Fazenda, Ian Beveridge, Neil B. Chilton, Aaron R. Jex, Aradhana Pangasa, Bronwyn E. Campbell, Florence Huby‐Chilton, Luís Madeira de Carvalho, Robin B. Gasser

Notice bibliographique

RevueElectrophoresis · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyInternal transcribed spacerGenBankRibosomal DNASpecies complexEvolutionary biologyGeneticsGenetic variationGenotypeRibosomal RNAZoologyPhylogeneticsPhylogenetic treeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Three species of Globocephaloides, parasitic nematodes occurring in macropodid marsupials in different areas of Australia, were characterized by the sequences of the first and second internal transcribed spacers (ITS-1 and ITS-2) of nuclear ribosomal DNA. Samples were subjected to PCR-coupled SSCP analysis and targeted sequencing, in order to assess genetic variation within and among individuals from different host species. Both SSCP and sequence data supported the current classification of morphospecies. Contrary to a previous hypothesis that cryptic species exist within the Globocephaloides trifidospicularis "complex", no or minor (0.2%) variation was detected among individuals from different hosts or geographical origins. Within G. macropodis populations, there was a consistent difference in both the ITS-1 (5.2%) and ITS-2 (7.1%) sequences between individuals derived from Macropus agilis and those from Macropus dorsalis. Although the results suggested that G. macropodis from each host species represented sibling species, future morphological study of individuals representing each G. macropodis genotype is warranted to provide further support for this hypothesis. (Nucleotide sequence data have been deposited in the GenBank database under accession nos. GQ131400-GQ131409.).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,440
Score d'incertitude au seuil0,732

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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