MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2043694845 · doi:10.1021/bi0485326

Interaction of LDS-751 with P-Glycoprotein and Mapping of the Location of the R Drug Binding Site

2005· article· en· W2043694845 sur OpenAlexaff
Miguel R. Lugo, Frances J. Sharom

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBinding siteP-glycoproteinChemistryATP-binding cassette transporterTransporterFörster resonance energy transferBiochemistryPlasma protein bindingBiophysicsCytoplasmFluorescenceStereochemistryBiologyMultiple drug resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One cause of multidrug resistance is the overexpression of P-glycoprotein, a 170 kDa plasma membrane ABC transporter, which functions as an ATP-driven efflux pump with broad specificity for hydrophobic drugs, peptides, and natural products. The protein appears to interact with its substrates within the membrane environment. Previous reports suggested the existence of at least two binding sites, possibly overlapping and displaying positively cooperative interactions, termed the H and R sites for their preference for Hoechst 33342 and rhodamine 123, respectively. In this work, we have used several fluorescence approaches to characterize the molecular interaction of purified P-glycoprotein (Pgp) with the dye LDS-751, which is proposed to bind to the R site. A 50-fold enhancement of LDS-751 fluorescence indicated that the protein binding site was located in a hydrophobic environment, with a polarity lower than that of chloroform. LDS-751 bound with sub-micromolar affinity (K(d) = 0.75 microM) and quenched P-glycoprotein intrinsic Trp fluorescence by 40%, suggesting that Trp emitters are probably located close to the drub-binding regions of the transporter and may interact directly with the dye. Using a FRET approach, we mapped the possible locations of the LDS-751 binding site relative to the NB domain active sites. The R site appeared to be positioned close to the membrane boundary of the cytoplasmic leaflet. The location of both H and R drug binding sites is in agreement with the idea that Pgp may operate as a drug flippase, moving substrates from the inner leaflet to the outer leaflet of the plasma membrane.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,119

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemistryMême sujetDrug Transport and Resistance MechanismsTravaux en français237 207