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Enregistrement W2043730281 · doi:10.1007/s00005-011-0147-9

The Transcription Factor PU.1 is a Critical Regulator of Cellular Communication in the Immune System

2011· review· en· W2043730281 sur OpenAlexafffund
Shereen A. Turkistany, Rodney P. DeKoter

Notice bibliographique

RevueArchivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis · 2011
Typereview
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensChildren’s Health Research InstituteLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyImmune systemTranscription factorCell biologyCytokineHaematopoiesisReceptorRegulatorGeneGeneticsStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PU.1 is an E26 transformation-specific family transcription factor that is required for development of the immune system. PU.1 functions at both early and late stages of lymphoid and myeloid differentiation. At least 110 direct target genes of PU.1 have been identified since its discovery in 1988. We used the published literature to determine if aspects of PU.1 function can be inferred from the identity of target genes that are directly activated. This analysis revealed that 61% of described PU.1 target genes encode extracellular proteins or transmembrane proteins, most of which are involved in cellular communication. The genes activated by PU.1 can be grouped into pathways based on function. Specific examples of cellular communication pathways regulated by PU.1 include (1) antibodies and antibody receptors, (2) cytokines and cytokine receptors regulating leukocyte growth and development, and (3) cytokines and cytokine receptors regulating inflammation. As a consequence of mutation or repression of the gene encoding PU.1, hematopoietic progenitors may be generated but there is a "failure to thrive" because they cannot interact with their environment. The loss of cellular communication caused by reduced PU.1 levels can lead to leukemia. In summary, PU.1 is a critical regulator of cellular communication in the immune system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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