Underexpression of tumour suppressor LKB1 in clear cell renal cell carcinoma is common and confers growth advantage in vitro and in vivo
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Evidence suggests that dysregulation of energy-sensing pathways closely associates with renal cell carcinoma (RCC) development. The metabolic regulation is largely controlled by 5'-AMP activated protein kinase (AMPK) which is activated through phosphorylation by LKB1. METHODS: The expression of LKB1 was determined by reverse transcription-PCR using 10 clinical clear cell RCC (ccRCC) samples and their adjacent normal renal parenchyma, and by immunohistochemical staining of two tissue microarrays containing 201 ccRCC and 26 normal kidney samples. Expression of LKB1 was knocked down in human ccRCC 786-O cells (shLKB1) and compared with cells expressing scrambled control shRNA (shControl). AMPK signalling, proliferation, invasion, and VEGF secretion was measured. The cells were subcutaneously injected into mice to determine tumour growth in vivo. RESULTS: At the protein and transcript levels, a significant reduction in LKB1 expression in tumour compared with normal tissue was found. In vitro, knockdown of LKB1 resulted in reduced AMPK signalling and increased cellular proliferation, invasion, and VEGF secretion compared with shControl cells. In vivo, growth of shLKB1 ccRCC xenografts in nude mice was significantly increased compared with shControl xenografts. CONCLUSION: Collectively, our results suggest that LKB1 acts as a tumour suppressor in most sporadic cases of ccRCC and that underexpression of LKB1 is a common event in the disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».