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Enregistrement W2043857622 · doi:10.1038/bjc.2012.574

Underexpression of tumour suppressor LKB1 in clear cell renal cell carcinoma is common and confers growth advantage in vitro and in vivo

2013· article· en· W2043857622 sur OpenAlexafffund
Wilhelmina Duivenvoorden, Laura K. Beatty, Šárka Lhoták, Brianne Hill, Isabella W.Y. Mak, Gregory Paulin, Daniel Gallino, Snežana Popović, Richard C. Austin, Jehonathan H. Pinthus

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensJuravinski Cancer CentreMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHamilton Health Sciences
Mots-clésBiologyAMPKClear cell renal cell carcinomaCancer researchCell growthGene knockdownIn vivoClear cellCell cultureProtein kinase AKinaseImmunohistochemistryRenal cell carcinomaPathologyCell biologyMedicineImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Evidence suggests that dysregulation of energy-sensing pathways closely associates with renal cell carcinoma (RCC) development. The metabolic regulation is largely controlled by 5'-AMP activated protein kinase (AMPK) which is activated through phosphorylation by LKB1. METHODS: The expression of LKB1 was determined by reverse transcription-PCR using 10 clinical clear cell RCC (ccRCC) samples and their adjacent normal renal parenchyma, and by immunohistochemical staining of two tissue microarrays containing 201 ccRCC and 26 normal kidney samples. Expression of LKB1 was knocked down in human ccRCC 786-O cells (shLKB1) and compared with cells expressing scrambled control shRNA (shControl). AMPK signalling, proliferation, invasion, and VEGF secretion was measured. The cells were subcutaneously injected into mice to determine tumour growth in vivo. RESULTS: At the protein and transcript levels, a significant reduction in LKB1 expression in tumour compared with normal tissue was found. In vitro, knockdown of LKB1 resulted in reduced AMPK signalling and increased cellular proliferation, invasion, and VEGF secretion compared with shControl cells. In vivo, growth of shLKB1 ccRCC xenografts in nude mice was significantly increased compared with shControl xenografts. CONCLUSION: Collectively, our results suggest that LKB1 acts as a tumour suppressor in most sporadic cases of ccRCC and that underexpression of LKB1 is a common event in the disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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