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Enregistrement W2043903698 · doi:10.1107/s0108767302085604

HIV integrase: from structure to drug design

2002· article· en· W2043903698 sur OpenAlexaff
Jingtao Chen, L. J. W. Micercke, J. Krucinski, Ann H. Tang, Janet Finer-Moore, Andrew D. Leavitt, Robert M. Stroud

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations of Crystallography · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensUniversity of AlbertaWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntegraseDrugIntegrase inhibitorVirologyHuman immunodeficiency virus (HIV)Antiretroviral drugMedicineComputational biologyPharmacologyAntiretroviral therapyBiologyViral load

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HIV-1 integrase catalyzes the insertion of viral DNA into the human chromosome, and as such, it is a target for the development of new anti-HIV drugs. Structural studies of HIV-1 integrase have been limited due to its insolubility. We have engineered a soluble, functional integrase by introducing five point mutations, and have solved the structure of the viral DNA binding core and C-terminal domains to 2.8 resolution. The Y-shaped, dimeric molecule reveals a putative DNA binding region consisting of residues contributed by both monomers of the dimer. This implies that a dimer is the minimal DNA binding unit. A kink at T210 occurs at a proteolytic cleavage site, suggesting a functional flexibility in the molecule that may be crucial for integration. The C-terminal domain is an SH3-like fold, and provides the majority of the crystal contacts, consistent with the role of the domain in oligomerization of integrase. Based on this structure, we are outlining new strategies to discover novel drug leads targeting integrase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,720
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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