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Enregistrement W2043994334 · doi:10.1021/pr200021n

Biospecimen Reporting for Improved Study Quality (BRISQ)

2011· article· en· W2043994334 sur OpenAlexaff
Helen M. Moore, Andréa B. Kelly, Scott D. Jewell, Lisa M. McShane, Douglas P. Clark, Renata Greenspan, Daniel F. Hayes, Pierre Hainaut, Paula Kim, Elizabeth Mansfield, Olga Potapova, Peter Riegman, Yaffa Rubinstein, Edward Seijo, Stella Somiari, Peter H. Watson, Heinz-Ulrich G. Weier, Claire S. Zhu, Jim Vaught

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésQuality (philosophy)Consistency (knowledge bases)Data scienceBiorepositoryComputer scienceMedicineRisk analysis (engineering)BiobankBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human biospecimens are subject to a number of different collection, processing, and storage factors that can significantly alter their molecular composition and consistency. These biospecimen preanalytical factors, in turn, influence experimental outcomes and the ability to reproduce scientific results. Currently, the extent and type of information specific to the biospecimen preanalytical conditions reported in scientific publications and regulatory submissions varies widely. To improve the quality of research utilizing human tissues, it is critical that information regarding the handling of biospecimens be reported in a thorough, accurate, and standardized manner. The Biospecimen Reporting for Improved Study Quality (BRISQ) recommendations outlined herein are intended to apply to any study in which human biospecimens are used. The purpose of reporting these details is to supply others, from researchers to regulators, with more consistent and standardized information to better evaluate, interpret, compare, and reproduce the experimental results. The BRISQ guidelines are proposed as an important and timely resource tool to strengthen communication and publications around biospecimen-related research and help reassure patient contributors and the advocacy community that the contributions are valued and respected.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,609
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,783
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,391
Score d'incertitude au seuil0,482

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,6090,783
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,007
Méta-épidémiologie (sens large)0,0080,006
Bibliométrie0,0240,032
Études des sciences et des technologies0,0050,009
Communication savante0,0230,014
Science ouverte0,0120,014
Intégrité de la recherche0,0170,021
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0350,051

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,977
Tête enseignante GPT0,770
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
DomainePrésentation des résultats
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations331
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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