Variability in Raman Spectra of Single Human Tumor Cells Cultured <i>in vitro</i>: Correlation with Cell Cycle and Culture Confluency
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Notice bibliographique
Résumé
In this work we investigate the capability of Raman microscopy (RM) to detect inherent sources of biochemically based spectral variability between single cells of a human tumor cell line (DU145) cultured in vitro. Principal component analysis (PCA) is used to identify differences in single-cell Raman spectra. These spectral differences correlate with (1) cell cycle progression and (2) changing confluency of a cell culture during the first 3 to 4 days after sub-culturing. Cell cycle regulatory drugs are used to synchronize the cell cycle progression of cell cultures, and flow cytometry is used to determine the cell cycle distribution of cell cultures at the time of Raman analysis. Spectral variability arising from cell cycle progression is (1) expressed as varying intensities of protein and nucleic acid features relative to lipid features, (2) well correlated with known biochemical changes in cells as they progress through the cell cycle, and (3) shown to be the most significant source of inherent spectral variability between cells. Furthermore, the specific biomolecules responsible for the observed spectral variability due to both cell cycle progression and changes in cell culture confluency can be identified in the first and second components of principal component analysis (PCA). Our characterization of the inherent sources of variability in Raman spectra of single human cells will be useful for understanding subtle spectral differences in RM studies of single cells.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle