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Enregistrement W2044219530 · doi:10.1074/jbc.m501627200

H1 Family Histones in the Nucleus

2005· article· en· W2044219530 sur OpenAlexafffund
John P.H. Th'ng, R.J. Sung, Ming Ye, Michael J. Hendzel

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensThunder Bay Regional Health Sciences CentreUniversity of AlbertaNOSM University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésHistoneNucleosomeChromatinBiologyHistone H1Histone H4Histone octamerFluorescence recovery after photobleachingCell biologyHistone codeBiochemistryMolecular biologyBiophysicsDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

H1 histones bind to DNA as they enter and exit the nucleosome. H1 histones have a tripartite structure consisting of a short N-terminal domain, a highly conserved central globular domain, and a lysine-and arginine-rich C-terminal domain. The C-terminal domain comprises approximately half of the total amino acid content of the protein, is essential for the formation of compact chromatin structures, and contains the majority of the amino acid variations that define the individual histone H1 family members. This region contains several cell cycle-regulated phosphorylation sites and is thought to function through a charge-neutralization process, neutralizing the DNA phosphate backbone to allow chromatin compaction. In this study, we use fluorescence microscopy and fluorescence recovery after photobleaching to define the behavior of the individual histone H1 subtypes in vivo. We find that there are dramatic differences in the binding affinity of the individual histone H1 subtypes in vivo and differences in their preference for euchromatin and heterochromatin. Further, we show that subtype-specific properties originate with the C terminus and that the differences in histone H1 binding are not consistent with the relatively small changes in the net charge of the C-terminal domains.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations195
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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