The effect of bisphosphonate acidity on the activity of a thymidylyltransferase
Notice bibliographique
Résumé
Thymidylyltransferases (thymidine diphospho pyrophosphorylases) are nucleotidylyltransferases that play key roles in the biosynthesis of carbohydrate components within bacterial cell walls and in the biosynthesis of glycosylated natural products. They catalyze the formation of sugar nucleotides concomitant with the release of pyrophosphate. Protein engineering of thymidylyltransferases has been an approach for the production of a variety of non-physiological sugar nucleotides. In this work, we have explored chemical approaches towards modifying the activity of the thymidylyltransferase (Cps2L) cloned from S. pneumoniae, through the use of chemically synthesized 'activated' nucleoside triphosphates with enhanced leaving groups, or by switching the metal ion co-factor specificity. Within a series of phosphonate-containing nucleoside triphosphate analogues, thymidylyltransferase activity is enhanced based on the acidity of the leaving group and a Brønsted-type analysis indicated that leaving group departure is rate limiting. We have also determined IC50 values for a series of bisphosphonates as inhibitors of thymidylyltransferases. No correlation between the acidity of the inhibitors (pKa) and the magnitude of enzyme inhibition was found.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».