Establishment and application of a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) system for detection of cry1Ac transgenic sugarcane
Notice bibliographique
Résumé
To meet the demand for detection of foreign genes in genetically modified (GM) sugarcane necessary for regulation of gene technology, an efficient method with high specificity and rapidity was developed for the cry1Ac gene, based on loop-mediated isothermal amplification (LAMP). A set of four primers was designed using the sequence of cry1Ac along with optimized reaction conditions: 5.25 mM of Mg(2+), 4:1 ratio of inner primer to outer primer, 2.0 U of Bst DNA polymerase in a reaction volume of 25.0 μL. Three post-LAMP detection methods (precipitation, calcein (0.60 mM) with Mn(2+) (0.05 mM) complex and SYBR Green I visualization), were shown to be effective. The sensitivity of the LAMP method was tenfold higher than that of conventional PCR when using templates of the recombinant cry1Ac plasmid or genomic DNA from cry1Ac transgenic sugarcane plants. More importantly, this system allowed detection of the foreign gene on-site when screening GM sugarcane without complex and expensive instruments, using the naked eye. This method can not only provide technological support for detection of cry1Ac, but can also further facilitate the use of this detection technique for other transgenes in GM sugarcane.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».