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Enregistrement W2044433413 · doi:10.2174/138920207780076965

H2A.Z-Mediated Genome-Wide Chromatin Specialization

2007· article· en· W2044433413 sur OpenAlexafffund
José M. Eirín‐López, Juan Ausió

Notice bibliographique

RevueCurrent Genomics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChromatinBiologyHistone-modifying enzymesHeterochromatinEuchromatinGeneticsHistone codeHistoneChIA-PETEpigenomicsChromatin remodelingComputational biologyNucleosomeDNAGeneGene expressionDNA methylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The characterization of the involvement of different histone post-translational modifications (PTMs) and histone variants in chromatin structure has represented one of the most recurrent topics in molecular biology during the last decade (since 1996). The interest in this topic underscores the critical roles played by chromatin in such important processes as DNA packaging, DNA repair and recombination, and regulation of gene expression. The genomic information currently available has pushed the boundaries of this research a step further, from the study of local domains to the genome-wide characterization of the mechanisms governing chromatin dynamics. How the heterchromatin and euchromatin compartmentalization is established has been the subject of recent extensive research. Many PTMs, as well as histone variants have been identified to play a role, including the replacement of histone H2A by the histone variant H2A.Z. Several studies have provided support to a role for H2A.Z (known as Htz1 in yeast) in transcriptional regulation, chromosome structure, DNA repair and heterochromatin formation. Although the mechanisms by which H2A.Z defines different structural regions in the chromatin have long remained elusive, various reports published last year have shed new insight into this process. The present mini review focuses its attention on the genome-wide distribution of H2A.Z, with special attention to the mechanisms involved in its distribution and exchange as well as on the role of its N-terminal acetylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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