Specific interaction of HeLa cell proteins with coxsackievirus B3 3'UTR: La autoantigen binds the 3' and 5'UTR independently of the poly(A) tail
Notice bibliographique
Résumé
Coxsackievirus B3 (CVB3) is a positive, single-stranded RNA virus. The secondary structure of the 3' untranslated region (3'UTR) of CVB3 RNA consists of three stem-loops and is followed by a poly(A) tail sequence. These stem-loop structures have been suggested to participate in the regulation of viral replication through interaction with cellular proteins that are yet to be identified. In this study, by competitive UV cross-linking using mutated 3'UTR probes we have demonstrated that the poly(A) tail is essential for promoting HeLa cell protein interactions with the 3'UTR because deletion of this sequence abolished most of the protein interactions. Unexpectedly, mutations that disrupted the tertiary loop-loop interactions without affecting the stem-loops did not apparently affect these protein interactions, indicating that secondary structure rather than the high-order structure may play a major role in recruiting these RNA binding proteins. Among the observed 3'UTR RNA binding proteins, we have confirmed a 52 kDa protein as the human La autoantigen by using purified recombinant protein and a polyclonal La antibody. This protein can interact with both the 3' and 5'UTRs independently of the poly(A) tail. Further analysis by two-stage UV cross-linking, we found that the 3' and 5'UTR sequences may share the same binding site on the La protein.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».