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Enregistrement W2044648571 · doi:10.1002/jmv.21758

Molecular characterization of hepatitis B virus and a 9‐year clinical profile in a patient infected with genotype I

2010· article· en· W2044648571 sur OpenAlexaffabout
Carla Osiowy, Kelly Kaita, Kaarina Solar, Kenneth Mendoza

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Virology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis B Virus Studies
Établissements canadiensUniversity of ManitobaCanadian Science Centre for Human and Animal Health
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésViral quasispeciesGenotypeVirologyBiologyGenotypingHepatitis B virusLamivudineGeneticsVirusViral evolutionGenetic diversityViral loadOrthohepadnavirusPopulationGenomeMolecular epidemiologyHepatitis C virusHepadnaviridaeGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An unusual hepatitis B virus (HBV) variant, assigned provisionally to genotype I, was recently reported, characterized by an anomalous genotyping pattern and putative recombination; however, the natural history of this unusual strain is unknown. This study analyzed longitudinal sera collected over a 9-year period from a patient infected with this variant to investigate the clinical profile and intrahost viral evolution over time. The patient, who had immigrated to Canada in 1998 from Vietnam, was treated with lamivudine in 2000. Approximately 4-5 years following the withdrawal of lamivudine therapy, a genomic "shift" occurred coincident with ALT flares and increasing HBV viral load, resulting in numerous stable nucleotide substitutions within the core coding region, suggesting altered immune control that may provide a selective advantage to the virus. Analysis of quasispecies diversity over time demonstrated further this shift, with two sequence clusters associated with time points either prior to or following relapse observed, including increased diversity among quasispecies prior to relapse. In keeping with the complex nature of genotype I strains, majority population genomes had a mean genetic distance from genotype C of 7.6 +/- 0.1%, although large genomic segments lacked significant homology with any HBV genotype. Further study is needed to understand the evolutionary origin and natural history of infection with this unique HBV variant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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