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Enregistrement W2044890688 · doi:10.1073/pnas.0506771102

Eukaryotic cells are dynamically ordered or critical but not chaotic

2005· article· en· W2044890688 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene Regulatory Network Analysis
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésChaoticRobustness (evolution)Nonlinear systemBoolean networkStatistical physicsBoolean functionGene regulatory networkStability (learning theory)Computer scienceSystems biologyBiological systemBiologyGenePhysicsComputational biologyGeneticsGene expressionArtificial intelligenceAlgorithm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two important theoretical approaches have been developed to generically characterize the relationship between the structure and function of large genetic networks: the continuous approach, based on reaction-kinetics differential equations, and the Boolean approach, based on difference equations and discrete logical rules. These two approaches do not always coincide in their predictions for the same system. Nonetheless, both of them predict that the highly nonlinear dynamics exhibited by genetic regulatory systems can be characterized into two broad regimes, to wit, an ordered regime where the system is robust against perturbations, and a chaotic regime where the system is extremely sensitive to perturbations. It has been a plausible and long-standing hypothesis that genomic regulatory networks of real cells operate in the ordered regime or at the border between order and chaos. This hypothesis is indirectly supported by the robustness and stability observed in the phenotypic traits of living organisms under genetic perturbations. However, there has been no systematic study to determine whether the gene-expression patterns of real cells are compatible with the dynamically ordered regimes predicted by theoretical models. Using the Boolean approach, here we show what we believe to be the first direct evidence that the underlying genetic network of HeLa cells appears to operate either in the ordered regime or at the border between order and chaos but does not appear to be chaotic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,287

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle