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Enregistrement W2044906864 · doi:10.1128/jb.183.17.5155-5162.2001

Roles of FrxA and RdxA Nitroreductases of <i>Helicobacter pylori</i> in Susceptibility and Resistance to Metronidazole

2001· article· en· W2044906864 sur OpenAlexaff
Jin-Yong Jeong, Asish K. Mukhopadhyay, Junko Akada, Daiva Dailidiene, Paul S. Hoffman, Douglas E. Berg

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious Diseases
Mots-clésBiologyNitroreductaseMutantMicrobiologyHelicobacter pyloriGeneWild typeGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The relative importance of the frxA and rdxA nitroreductase genes of Helicobacter pylori in metronidazole (MTZ) susceptibility and resistance has been controversial. Jeong et al. (J. Bacteriol. 182:5082--5090, 2000) had interpreted that Mtz(s) H. pylori were of two types: type I, requiring only inactivation of rdxA to became resistant, and type II, requiring inactivation of both rdxA and frxA to become resistant; frxA inactivation by itself was not sufficient to confer resistance. In contrast, Kwon et al. (Antimicrob. Agents Chemother. 44:2133--2142, 2000) had interpreted that resistance resulted from inactivation either of frxA or rdxA. These two interpretations were tested here. Resistance was defined as efficient colony formation by single cells from diluted cultures rather than as growth responses of more dense inocula on MTZ-containing medium. Tests of three of Kwon's Mtz(s) strains showed that each was type II, requiring inactivation of both rdxA and frxA to become resistant. In additional tests, derivatives of frxA mutant strains recovered from MTZ-containing medium were found to contain new mutations in rdxA, and frxA inactivation slowed MTZ-induced killing of Mtz(s) strains. Northern blot analyses indicated that frxA mRNA, and perhaps also rdxA mRNA, were more abundant in type II than in type I strains. We conclude that development of MTZ resistance in H. pylori requires inactivation of rdxA alone or of both rdxA and frxA, depending on bacterial genotype, but rarely, if ever, inactivation of frxA alone, and that H. pylori strains differ in regulation of nitroreductase gene expression. We suggest that such regulatory differences may be significant functionally during human infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,185
Score d'incertitude au seuil0,610

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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