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Enregistrement W2044967646 · doi:10.1186/1746-6148-8-156

The epidemiology of Clostridium perfringens type A on Ontario swine farms, with special reference to cpb2-positive isolates

2012· article· en· W2044967646 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueBMC Veterinary Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésWeanlingClostridium perfringensFecesVeterinary medicineBiologyDiarrheaMicrobiologyAnimal scienceMedicineGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: There is poor understanding of most aspects of Clostridium perfringens type A as a possible cause of neonatal diarrhea in piglets, and the prevalence and types of C. perfringens present on Ontario swine farms is unknown. To study the prevalence of fecal C. perfringens and selected toxin genes, 48 Ontario swine farms were visited between August 2010 and May 2011, and 354 fecal samples were collected from suckling pigs, lactating sows, weanling pigs, grower-finisher pigs, and gestating sows, as well as from manure pits. The fecal samples were cultured quantitatively, and toxin genes were detected by real-time multiplex polymerase chain reaction (PCR). RESULTS: In mixed multivariable linear analysis, log(10) C. perfringens in fecal samples from suckling pigs were higher than that of weanling pigs, grower-finisher pigs, and manure pit samples (P <0.05). In mixed multivariable logistic analysis, the C. perfringens isolates recovered from lactating sows (OR = 0.069, P <0.001), gestating sows (OR = 0.020, P <0.001), grower-finishers (OR = 0.017, P <0.001), and manure pits (OR = 0.11, P <0.001) were less likely to be positive for the consensus beta2 toxin gene cpb2 compared to the isolates from suckling pigs. The prevalence of cpb2 in the isolates recovered from weanlings did not differ significantly from suckling pigs. C. perfringens isolates that were positive for cpb2 were more likely to carry the atypical cpb2 gene (atyp-cpb2) (OR = 19, P <0.001) compared to isolates that were negative for cpb2. Multivariable analysis did not identify farm factors affecting the presence of consensus cpb2 and atyp-cpb2 genes. CONCLUSIONS: This study provides baseline data on the prevalence of C. perfringens and associated toxin genes in healthy pigs at different stages of production on Ontario swine farms. The study suggests that if C. perfringens type A are involved in neonatal enteritis, there may be strains with specific characteristics that cannot be identified by the existing genotyping system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,274
Score d'incertitude au seuil0,860

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,292
Tête enseignante GPT0,436
Écart entre enseignants0,145 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle