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Enregistrement W2044985063 · doi:10.3168/jds.2010-3447

Differential expression of genes in adipose tissue of first-lactation dairy cattle

2010· article· en· W2044985063 sur OpenAlexaff
Jennifer M. Thomson, J.L. Vierck, J.P. McNamara

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Science · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesWashington State University
Mots-clésAdipose tissueLactationDairy cattleGeneBiologyGene expressionMilk fatAnimal scienceMammary tissueMammary glandEndocrinologyGeneticsInternal medicineFood scienceMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adipose tissue metabolism is an essential factor in establishment of a successful lactation, and we have a good understanding of changes in metabolic flux in relation to lactation, parity, and diet. However, the mechanisms of control of flux are less well understood. To continue our investigations into the control of adipose tissue metabolism, we conducted a transcriptomic analysis of adipose tissue of dairy cattle in late pregnancy and early lactation. Our objective was to determine the changes in gene expression in adipose tissue between 30 d prepartum and 14 d in milk in first-lactation animals, and to determine if changes in expression were related to practical production variables. Animals were Holstein heifers fed the same diet to National Research Council requirements, and adipose tissue was biopsied at 30 d prepartum and 14 DIM. Total RNA was extracted and used to determine gene expression on a bovine gene array. Genes that code for proteins controlling fatty acid transport were highly expressed including fatty acid binding proteins (FABP4 and FABP5) and lipoprotein lipase. Among those genes increasing in expression were those controlling lipolysis, including ADRB2 (52%) and LIPE (23%). Many genes coding for enzymes controlling lipogenesis decreased, including SREBP (-25%), TSHSP14 (-30.8%), LPL (-48.4%), and ACACA (-63.9%). This gene expression array analysis in adipose tissue of lactating dairy cattle identifies several key genes that are components of the adaptation to lactation that can be incorporated into models of nutritional efficiency and may be amenable to genetic or dietary manipulation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations67
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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