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Enregistrement W2045193449 · doi:10.1094/pd-90-1287

Vegetative Compatibility Groups and Aggressiveness of North American Isolates of <i>Colletotrichum coccodes</i>, the Causal Agent of Potato Black Dot

2006· article· en· W2045193449 sur OpenAlexaboutno aff
Nadav Nitzan, Leah Tsror, Dennis A. Johnson

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPennsylvania State UniversityWashington State UniversityOhio State University
Mots-clésBiologyPopulationPepperBotanySolanaceaeHorticultureGeneGeneticsDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vegetative compatibility of 123 isolates of Colletotrichum coccodes from North America (United States and Canada) originating from potato, tomato, pepper, and mint was tested using nitrate-nonutilizing (nit) mutants. The North American isolates did not anastomose with previously selected European/Israeli vegetative compatibility group (VCG) testers; therefore, eight isolates were selected as VCG testers for the North American population. The 123 isolates distributed to seven VCGs at 1.6, 1.6, 4.0, 8.1, 13.8, 19.5, and 36.6%, with 14.6% of the isolates not assigned to any of the seven VCGs. Among the North American (NA)-VCGs, the average frequency of the nit1/nit3 nit mutants was lower (P < 0.05) for isolates belonging to NA-VCG1 than for isolates belonging to the NA-VCGs 2, 3, and 5. In contrast, the frequency of NitM nit mutants did not vary (P > 0.05) among the NA-VCGs and was collectively 5.14%. The results also indicated significant (P < 0.05) differences among NA-VCGs and European/Israeli (EU/I)-VCGs regarding the frequency of nit mutants. The aggressiveness trials of the North American isolates to potato indicated that plants infected with isolates belonging to NA-VCG2 and NA-VCG5 had more (P < 0.05) sclerotia on the roots and crowns than plants infected with isolates belonging to NA-VCGs 1 and 3. The plants infected with isolates belonging to NA-VCG2 had sclerotia formed higher (P < 0.05) up the stem than the plants infected with isolates belonging to NA-VCGs 1, 3, or 5. The plants infected with isolates assigned to NA-VCG2 had more (P < 0.05) infected progeny tubers than the plants infected with isolates belonging to NA-VCGs 1, 3, or 5; and the plants infected with isolates belonging to NA-VCGs 1, 2, and 5 yielded fewer (P < 0.05) potato tubers than the noninoculated control plants. A naming system for the population of C. coccodes based on the continent source of the population, the VCG number, and the isolate's code was suggested.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,149
Score d'incertitude au seuil0,418

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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