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Enregistrement W2045316789 · doi:10.1042/bj20020253

Regulation of nuclear translocation of nuclear factor-kappaB relA: evidence for complex dynamics at the single-cell level

2003· article· en· W2045316789 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensResearch & Development Corporation
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial Research
Mots-clésChromosomal translocationBiologyCell nucleusP50EndogenyStimulationCytoplasmMolecular biologyElectrophoretic mobility shift assayNuclear localization sequenceCellNuclear transportIntracellularCell biologyTranscription factorEndocrinologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have analysed activation of nuclear factor-kappaB (NF-kappaB) in response to interleukin-1 (IL-1) in human fibroblasts by tracking intracellular distribution and levels of endogenous relA, NF-kappaB1 and inhibitor of kappaB (I-kappaB) alpha using semi-quantitative confocal microscopy. Nuclear translocation of endogenous relA correlated with I-kappaBalpha degradation during stimulation with IL-1, whereas no effects were seen on levels or localization of NF-kappaB1. During pathway activation, relA was transported up a concentration gradient, resulting in a 3-4-fold increase in nuclear levels, but without any significant decrease in cytoplasmic concentration. IL-1 stimulation caused translocation of only 20% of the relA, but resulted in degradation of up to 70% of the cytoplasmic I-kappaBalpha. RelA nuclear translocation in fibroblasts correlated with DNA-binding activity measured by electrophoretic mobility shift assay (EMSA), both with respect to kinetics and IL-1 concentration-dependence. Clonal populations of cells demonstrated a marked degree of heterogeneity in the response to IL-1. The single-cell assay revealed the presence of responder and non-responder subpopulations, with an enhanced proportion of responder cells, and prolonged responses at higher concentrations of IL-1. Comparing different cell types demonstrated that whereas HepG2 cells, as fibroblasts, showed good correlation between nuclear translocation of relA and activation of DNA binding by relA-containing dimers, EL4 thymoma cells showed no effect on relA localization, even during induction of significant levels NF-kappaB activity, as measured by EMSA. The analysis shows that stimulation by IL-1 results in transient perturbation of the NF-kappaB system, which cycles between the resting and active states with net redistribution of a minor proportion of its DNA-binding component. In addition, it demonstrates significant cell-to-cell variations, as well as cell-type-specific differences in net relA nuclear transport in response to stimuli. The data are consistent with NF-kappaB constituting a dynamic and versatile system, regulated to a significant degree by binary events involving bidirectional trafficking between the cytoplasmic and nuclear compartments during pathway activation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,435

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle