MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2045348172 · doi:10.1242/jeb.038752

Functional characterization of Rhesus glycoproteins from an ammoniotelic teleost, the rainbow trout, using oocyte expression and SIET analysis

2010· article· en· W2045348172 sur OpenAlexafffund
C. Michele Nawata, Chris M. Wood, Michael J. O’Donnell

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésRainbow troutOocyteGlycoproteinRainbowFisheryBiologyComputational biologyZoologyFish <Actinopterygii>Molecular biologyEmbryoPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent experimental evidence from rainbow trout suggests that gill ammonia transport may be mediated in part via Rhesus (Rh) glycoproteins. In this study we analyzed the transport properties of trout Rh proteins (Rhag, Rhbg1, Rhbg2, Rhcg1, Rhcg2, Rh30-like) expressed in Xenopus oocytes, using the radiolabeled ammonia analogue [(14)C]methylamine, and the scanning ion electrode technique (SIET). All of the trout Rh proteins, except Rh30-like, facilitated methylamine uptake. Uptake was saturable, with K(m) values ranging from 4.6 to 8.9 mmol l(-1). Raising external pH from 7.5 to 8.5 resulted in 3- to 4-fold elevations in J(max) values for methylamine; K(m) values were unchanged when expressed as total or protonated methylamine. Efflux of methylamine was also facilitated in Rh-expressing oocytes. Efflux and influx rates were stimulated by a pH gradient, with higher rates observed with steeper H(+) gradients. NH(4)Cl inhibited methylamine uptake in oocytes expressing Rhbg1 or Rhcg2. When external pH was elevated from 7.5 to 8.5, the K(i) for ammonia against methylamine transport was 35-40% lower when expressed as total ammonia or NH(4)(+), but 5- to 6-fold higher when expressed as NH(3). With SIET we confirmed that ammonia uptake was facilitated by Rhag and Rhcg2, but not Rh30-like proteins. Ammonia uptake was saturable, with a comparable J(max) but lower K(m) value than for total or protonated methylamine. At low substrate concentrations, the ammonia uptake rate was greater than that of methylamine. The K(m) for total ammonia (560 micromol l(-1)) lies within the physiological range for trout. The results are consistent with a model whereby NH(4)(+) initially binds, but NH(3) passes through the Rh channels. We propose that Rh glycoproteins in the trout gill are low affinity, high capacity ammonia transporters that exploit the favorable pH gradient formed by the acidified gill boundary layer in order to facilitate rapid ammonia efflux when plasma ammonia concentrations are elevated.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,159
Score d'incertitude au seuil0,923

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Experimental BiologyMême sujetPhysiological and biochemical adaptationsTravaux en français237 207