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Enregistrement W2045404590 · doi:10.1016/s0378-1097(03)00178-2

The collagenase activity of<i>Porphyromonas gingivalis</i>is due to Arg-gingipain

2003· article· en· W2045404590 sur OpenAlexafffund
Marie-Andrée Houle, Daniel Grenier, Pascale Plamondon, Koji Nakayama

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueOral microbiology and periodontitis research
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPorphyromonas gingivalisLeupeptinCollagenasePepstatinChemistryGel electrophoresisCathepsinProteasePolyacrylamide gel electrophoresisBiochemistryMolecular biologyAutolysis (biology)Sodium dodecyl sulfateMicrobiologyType I collagenProteasesEnzymeBiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Degradation of type I collagen by Porphyromonas gingivalis was monitored by fluorogenic, sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE), and growth assays. All three assays showed that inactivation of both the rgpA and rgpB genes was necessary to completely eliminate the capacity of P. gingivalis to cleave type I collagen. Leupeptin, an Arg-gingipain-specific protease inhibitor, almost completely inhibited collagen degradation by P. gingivalis cells whereas cathepsin B inhibitor II, a Lys-gingipain inhibitor, did not. A purified preparation of Arg-gingipains A and B hydrolyzed gelatin but did not cleave type I collagen, suggesting that the enzymes must be attached to the cell surface to exert collagenase activity. A number of substances used as adjuncts in periodontal therapy were also tested for their capacity to inhibit collagenase activity of P. gingivalis. Tetracycline, doxycycline, and chlorhexidine strongly inhibited collagenase activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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