Ontogenetic De Novo Copy Number Variations (CNVs) as a Source of Genetic Individuality: Studies on Two Families with MZD Twins for Schizophrenia
Notice bibliographique
Résumé
Genetic individuality is the foundation of personalized medicine, yet its determinants are currently poorly understood. One issue is the difference between monozygotic twins that are assumed identical and have been extensively used in genetic studies for decades. Here, we report genome-wide alterations in two nuclear families each with a pair of monozygotic twins discordant for schizophrenia evaluated by the Affymetrix 6.0 human SNP array. The data analysis includes characterization of copy number variations (CNVs) and single nucleotide polymorphism (SNPs). The results have identified genomic differences between twin pairs and a set of new provisional schizophrenia genes. Samples were found to have between 35 and 65 CNVs per individual. The majority of CNVs (~80%) represented gains. In addition, ~10% of the CNVs were de novo (not present in parents), of these, 30% arose during parental meiosis and 70% arose during developmental mitosis. We also observed SNPs in the twins that were absent from both parents. These constituted 0.12% of all SNPs seen in the twins. In 65% of cases these SNPs arose during meiosis compared to 35% during mitosis. The developmental mitotic origin of most CNVs that may lead to MZ twin discordance may also cause tissue differences within individuals during a single pregnancy and generate a high frequency of mosaics in the population. The results argue for enduring genome-wide changes during cellular transmission, often ignored in most genetic analyses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».