Genetic Evidence Links the ASTRA Protein Chaperone Component Tti2 to the SAGA Transcription Factor Tra1
Notice bibliographique
Résumé
Tra1 is a 3744-residue component of the Saccharomyces cerevisiae SAGA, NuA4, and ASTRA complexes. Tra1 contains essential C-terminal PI3K and FATC domains, but unlike other PIKK (phosphoinositide three-kinase-related kinase) family members, lacks kinase activity. To analyze functions of the FATC domain, we selected for suppressors of tra1-F3744A, an allele that results in slow growth under numerous conditions of stress. Two alleles of TTI2, tti2-F328S and tti2-I336F, acted in a partially dominant fashion to suppress the growth-related phenotypes associated with tra1-F3744A as well as its resulting defects in transcription. tti2-F328S suppressed an additional FATC domain mutation (tra1-L3733A), but not a mutation in the PI3K domain or deletions of SAGA or NuA4 components. We find eGFP-tagged Tti2 distributed throughout the cell. Tti2 is a component of the ASTRA complex, and in mammalian cells associates with molecular chaperones in complex with Tti1 and Tel2. Consistent with this finding, Tra1 levels are reduced in a strain with a temperature-sensitive allele of tel2. Further agreeing with a possible role for Tti2 in the folding or stabilization of Tra1, tra1-F3744A was mislocalized to the cytoplasm, particularly under conditions of stress. Since an intragenic mutation of tra1-R3590I also suppressed F3744A, we propose that Tti2 is required for the folding/stability of the C-terminal FATC and PI3K domains of Tra1 into their functionally active form.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».