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Enregistrement W2045549815 · doi:10.1074/jbc.m406302200

Apolipoprotein B-containing Lipoprotein Particle Assembly

2004· article· en· W2045549815 sur OpenAlexaff
Medha Manchekar, P.E. Richardson, Trudy M. Forte, Geeta Datta, Jere P. Segrest, Nassrin Dashti

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiabetes, Cardiovascular Risks, and Lipoproteins
Établissements canadiensThrombosis and Atherosclerosis Research Institute
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésApolipoprotein BChemistryMicrosomal triglyceride transfer proteinLipoproteinPhospholipidBiochemistryCholesteryl esterParticle (ecology)ChromatographyVery low-density lipoproteinBiologyCholesterol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously proposed that the N-terminal 1000-residue betaalpha(1) domain of apolipoprotein B (apoB) forms a bulk lipid pocket homologous to that of lamprey lipovitellin. In support of this "lipid pocket" hypothesis, we demonstrated that apoB:1000 (residues 1-1000) is secreted by a stable transformant of McA-RH7777 cells as a monodisperse particle with high density lipoprotein 3 (HDL(3)) density. In contrast, apoB:931 (residues 1-931), missing only 69 residues of the sequence homologous to lipovitellin, was secreted as a particle considerably more dense than HDL(3). In the present study we have determined the stoichiometry of the lipid component of the apoB:931 and apoB:1000 particles. The secreted [(3)H]glycerol-labeled apoB:1000 particles, isolated by nondenaturing gradient gel electrophoresis, contained 50 phospholipid (PL) and 11 triacylglycerol (TAG) molecules/particle. In contrast, apoB:931 particles contained only a few molecules of PL and were devoid of TAG. The unlabeled apoB:1000 particles, isolated by immunoaffinity chromatography, contained 56 PL, 8 TAG, and 7 cholesteryl ester molecules/particle. The surface to core lipid ratio of apoB:1000-containing particles was approximately 4:1 and was not affected by oleate supplementation. Although very small amounts of microsomal triglyceride transfer protein (MTP) were associated with apoB:1000 particles, it never approached a 1:1 molar ratio of MTP to apoB. These results support a model in which (i) the first 1000 amino acid residues of apoB are competent to complete the lipid pocket without a structural requirement for MTP; (ii) a portion, or perhaps all, of the amino acid residues between 931 and 1000 of apoB-100 are critical for the formation of a stable, bulk lipid-containing nascent lipoprotein particle, and (iii) the lipid pocket created by the first 1000 residues of apoB-100 is PL-rich, suggesting a small bilayer type organization and has a maximum capacity on the order of 50 molecules of phospholipid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations60
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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