A Metabolomic Study To Identify New Globotriaosylceramide-Related Biomarkers in the Plasma of Fabry Disease Patients
Notice bibliographique
Résumé
Fabry disease is an X-linked lysosomal storage disorder caused by a deficiency of the enzyme α-galactosidase A, which results in the progressive accumulation of glycosphingolipids. In addition to the two biomarkers, globotriaosylceramide (Gb3) and globotriaosylsphingosine (lyso-Gb3), which are routinely used for detection and high-risk screening of Fabry disease patients, novel urinary Gb3-related isoforms/analogues as well as newly defined lyso-Gb3 analogues in plasma and urine from Fabry patients have recently been described by our group. The aim of this study was to extend our recent analyses to identify and evaluate new potential Gb3-related biomarkers in the plasma of untreated male Fabry disease patients using a mass spectrometry metabolomic approach. A multivariate statistical analysis revealed five Gb3-related novel biomarkers in the plasma of male Fabry patients. Three of these new biomarkers correspond to Gb3, which has an extra double bond on the sphingosine with C16:0, C18:0, and C22:1 fatty acid chains. The fourth biomarker corresponds to a mixture of two structural isomers, the first with a d16:1 sphingosine and a C16:0 fatty acid and the second with a d18:1 sphingosine and a C14:0 fatty acid. To our knowledge, it is the first time that a Gb3 analogue with a d16:1 sphingosine moiety has been reported. In addition, this Gb3 analogue was also present in its methylated form. These biomarkers are part of a metabolic profile that may provide insight into the pathophysiology of Fabry disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».