MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2045610148 · doi:10.1002/ana.22107

Assessment of JC virus DNA in blood and urine from natalizumab‐treated patients

2010· article· en· W2045610148 sur OpenAlexaff
Richard A. Rudick, Paul O’Connor, Chris H. Polman, Andrew Goodman, Soma Ray, Nancy M. Griffith, Stéphanie Jurgensen, Leonid Gorelik, Fiona Forrestal, Alfred Sandrock, Susan Goelz

Notice bibliographique

RevueAnnals of Neurology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePolyomavirus and related diseases
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institutes of HealthIC Design Education CenterBiogen
Mots-clésNatalizumabProgressive multifocal leukoencephalopathyJC virusMultiple sclerosisMedicineUrineVirologyPolymerase chain reactionReal-time polymerase chain reactionPeripheral blood mononuclear cellInternal medicineImmunologyGastroenterologyBiologyIn vitroGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Analyses were conducted to determine the clinical utility of measuring JC virus (JCV) DNA in blood or urine of natalizumab-treated multiple sclerosis (MS) patients to predict the risk of progressive multifocal leukoencephalopathy (PML). METHODS: A total of 12,850 blood and urine samples from nearly 1,400 patients participating in natalizumab clinical trials were tested for JCV DNA using a commercially available quantitative polymerase chain reaction (qPCR) assay. A subset of these samples was also tested using a more sensitive qPCR assay developed at the National Institutes of Health (NIH). RESULTS: At the time natalizumab dosing was suspended, JCV DNA was detected in plasma by the commercial assay in 4 of 1,397 (0.3%) patients; the NIH assay confirmed these positive samples and detected JCV DNA in an additional 2 of 205 (1%) patients who tested negative with the commercial assay. None of these 6 JCV DNA positive patients developed PML. In a 48-week study testing the safety of natalizumab redosing, JCV DNA was detected in plasma of 6 of 1,094 (0.3%) patients, none of whom developed PML. Urine at baseline and week 48 was assessed in 224 patients; 58 (26%) were positive at baseline, and 55 (25%) were positive after 48 weeks of natalizumab, treatment. JCV DNA was not detected in peripheral blood mononuclear cells from any of these 1,094 patients before or after natalizumab treatment. In 5 patients who developed PML, JCV DNA was not detected in blood at any time point before symptoms first occurred. INTERPRETATION: Measuring JCV DNA in blood or urine with currently available methods is unlikely to be useful for predicting PML risk in natalizumab-treated MS patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAnnals of NeurologyMême sujetPolyomavirus and related diseasesTravaux en français237 207