MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2045650818 · doi:10.1038/sj.bjc.6605097

Association of apolipoprotein E polymorphisms and dietary factors in colorectal cancer

2009· article· en· W2045650818 sur OpenAlexafffund
Miralem Mrkonjic, Edward Chappell, Vaijayanti Pethe, M. Manno, Darshana Daftary, Celia M.T. Greenwood, Steve Gallinger, Brent W. Zanke, Julia A. Knight, Bharati Bapat

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensUniversity of OttawaHealth CanadaMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePublic Health OntarioUniversity of TorontoCancer Care Ontario
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchAmerican Institute for Cancer Research
Mots-clésApolipoprotein EColorectal cancerRed meatSingle-nucleotide polymorphismGenotypeInternal medicineAlleleLogistic regressionMedicineCancerGastroenterologyBiologyOncologyDiseaseGeneticsPathologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ApoE single nucleotide polymorphisms (SNPs) Cys112Arg (Epsilon-4), and Arg158Cys (Epsilon-2) have been implicated in cardiovascular and Alzheimer's disease, but their role in colorectal cancer (CRC) has not been extensively studied. We investigated whether ApoE polymorphisms alone or in combination with dietary factors selectively contribute to mismatch-repair (MMR) proficient (microsatellite stable/low or MSS/L) vs deficient (microsatellite unstable or MSI-H) CRCs. We carried out a case-control study with 906 CRC cases and 911 unaffected controls to examine the associations between ApoE polymorphisms and dietary factors and assessed their contribution to MSS/L and MSI-H CRCs. We used unconditional logistic regression to evaluate the associations between ApoE SNPs, tumour MSI status, and dietary factors after adjusting for age and sex. All statistical tests were two-sided. No significant differences in ApoE genotype frequencies were observed between CRC cases and unaffected controls. We observed that increased dietary intake of total fat, saturated fat, cholesterol, and red meat was significantly associated with CRC. Among non-ApoE4 carriers, 2-4 and >4 red meat servings/week were associated with developing MSS/L CRC (OR=1.51, 95% CI 1.10-2.07 and OR=1.80, 95% CI 1.30-2.48, respectively), whereas among ApoE4 allele carriers, four or more red meat servings/week were associated with MSI-H CRC (OR=4.62, 95% CI 1.20-17.77) when compared with the controls. ApoE isoforms modulate the risk of MSI-H and MSS/L CRCs among high red meat consumers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,187
Score d'incertitude au seuil0,607

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBritish Journal of CancerMême sujetGenetic factors in colorectal cancerTravaux en français237 207