Characterization of a temperature‐sensitive mutation that impairs the function of yeast tRNA nucleotidyltransferase
Notice bibliographique
Résumé
ATP(CTP) : tRNA nucleotidyltransferase catalyses the posttranscriptional addition of cytidine, cytidine and adenosine to the 3' ends of tRNAs. Previously, a temperature-sensitive phenotype in Saccharomyces cerevisiae resulting from a mutation in the CCA1 gene coding for this enzyme was identified. Here, we show that a single guanine-to-adenine transition in cca1-1 generates the temperature-sensitive phenotype. Alignment of the amino acid sequence of S. cerevisiae tRNA nucleotidyltransferase with other tRNA nucleotidyltransferases for which crystal structures have been solved suggests that the resulting Glu-to-Lys substitution is in a ss-turn connecting the structurally and functionally important head and neck domains of the protein. Proteins containing Gln, His or Phe at this position were constructed to further characterize the importance of this residue in enzyme structure and function. As with the Lys variant, the Phe and His variants generate a temperature-sensitive phenotype in isogenic yeast strains, further supporting the role of this position in maintaining the structure and function of this enzyme. Comparative biophysical and biochemical characterization of both the wild-type and variant proteins indicates that amino acid substitutions at this position can result in a structural change in the protein that reduces enzyme activity (both at the permissive and non-permissive temperatures), decreases the melting temperature of the protein and alters its stability at the non-permissive temperature (37 degrees C).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».