Contribution of cathepsin L to secretome composition and cleavage pattern of mouse embryonic fibroblasts
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Notice bibliographique
Résumé
The endolysosomal cysteine endoprotease cathepsin L is secreted from cells in a variety of pathological conditions such as cancer and arthritis. We compared the secretome composition and extracellular proteolytic cleavage events in cell supernatants of cathepsin L-deficient and wild-type mouse embryonic fibroblasts (MEFs). Quantitative proteomic comparison of cell conditioned media indicated that cathepsin L deficiency affects, albeit in a limited manner, the abundances of extracellular matrix (ECM) components, signaling proteins, and further proteases as well as endogenous protease inhibitors. Immunodetection corroborated that cathepsin L deficiency results in decreased abundance of the ECM protein periostin and elevated abundance of matrix metalloprotease (MMP)-2. While mRNA levels of MMP-2 were not affected by cathepsin L ablation, periostin mRNA levels were reduced, potentially indicating a downstream effect. To characterize cathepsin L contribution to extracellular proteolysis, we performed terminal amine isotopic labeling of substrates (TAILS), an N-terminomic technique for the identification and quantification of native and proteolytically generated protein N-termini. TAILS identified >1500 protein N-termini. Cathepsin L deficiency predominantly reduced the magnitude of collagenous cleavage sites C-terminal to a proline residue. This contradicts cathepsin L active site specificity and indicates altered activity of further proteases as a result of cathepsin L ablation.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle