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Enregistrement W2045783452 · doi:10.1242/jeb.01755

Computer simulations of high-pass filtering in zebrafish larval muscle fibres

2005· article· en· W2045783452 sur OpenAlexaff
Steven D. Buckingham, Declan W. Ali

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDepolarizationSodiumDanioPotassiumBiophysicsSodium channelTime constantChemistrySteady state (chemistry)ElectrophysiologyMembrane potentialIonZebrafishNeuroscienceBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Larval somatic muscle of the zebrafish, Danio rerio, like that of some other organisms, responds to a sustained depolarization with one, and only one, action potential. Here, we report computer simulations, using the NEURON simulation programme, of sodium and potassium currents of somatic muscle of larval Danio rerio to investigate their possible contribution to once-only firing. Our computer model incorporated simulated sodium and potassium ion channels based on steady-state and kinetic parameters derived from a recent electrophysiological study. The model responded to sustained depolarizations with a single action potential at all levels of depolarization above threshold. By varying several parameters of the sodium and potassium currents systematically, the minimum changes necessary to produce repetitive firing were found to be a positive shift in the half-inactivation and a negative shift in the half-activation potentials for the sodium current, accompanied by a slowing of the rate of inactivation to half of the experimentally observed values. This suggests that once-only spiking can be attributed to the steady-state values of activation and inactivation of the sodium current, along with a slower rate of inactivation. Mapping of the resultant firing properties against steady-state and kinetic ion channel parameters revealed a high safety factor for once-only firing and showed that the time constant of inactivation of the sodium current was the key determinant of once-only or repetitive firing. The rapidly inactivating potassium current does not influence once-only firing or the maximum rate of firing in response to periodic excitation in these simulations. Although a contribution of other currents to produce once-only firing has not been excluded, this model suggests that the properties of the sodium current are sufficient to account for once-only firing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,063

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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