Temperature Dependence of Three-Body Hydrophobic Interactions: Potential of Mean Force, Enthalpy, Entropy, Heat Capacity, and Nonadditivity
Notice bibliographique
Résumé
Temperature-dependent three-body hydrophobic interactions are investigated by extensive constant-pressure simulations of methane-like nonpolar solutes in TIP4P model water at six temperatures. A multiple-body hydrophobic interaction is considered to be (i) additive, (ii) cooperative, or (iii) anti-cooperative if its potential of mean force (PMF) is (i) equal to, (ii) smaller than, or (iii) larger than the corresponding pairwise sum of two-methane PMFs. We found that three-methane hydrophobic interactions at the desolvation barrier are anti-cooperative at low to intermediate T, and vary from essentially additive to slightly cooperative at high T. Interactions at the contact minimum are slightly anti-cooperative over a wider temperature range. Enthalpy, entropy, and heat capacity are estimated from the computed PMFs. Contrary to the common expectation that burial of solvent-accessible nonpolar surface area always leads to a decrease in heat capacity, the present results show that the change in heat capacity upon three-methane association is significantly positive at the desolvation barrier and slightly positive at the contact minimum. This suggests that the heat capacity signature of a hydrophobic polymer need not vary uniformly nor monotonically with conformational compactness. Ramifications for protein folding are discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».