MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2045872263 · doi:10.1074/jbc.m105635200

HMG-D and Histone H1 Interplay during Chromatin Assembly and Early Embryogenesis

2001· article· en· W2045872263 sur OpenAlexaff
Sarbjit S. Ner, Thiemo Blank, M. Luz Pérez‐Parallé, Thomas A. Grigliatti, Peter B. Becker, Andrew Travers

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésChromatinHistone H1NucleosomeBiologyHistoneLinker DNACell biologyHistone codeChromatosomeEmbryoMolecular biologyGeneticsDNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HMG-D is an abundant chromosomal protein associated with condensed chromatin during the first nuclear cleavage cycles of the developing Drosophila embryo. We previously suggested that HMG-D might substitute for the linker histone H1 in the preblastoderm embryo and that this substitution might result in the characteristic less compacted chromatin. We have now studied the association of HMG-D with chromatin using a cell-free system for chromatin reconstitution derived from Drosophila embryos. Association of HMG-D with chromatin, like that of histone H1, increases the nucleosome spacing indicative of binding to the linker DNA between nucleosomes. HMG-D interacts with DNA during the early phases of nucleosome assembly but is gradually displaced as chromatin matures. By contrast, purified chromatin can be loaded with stoichiometric amounts of HMG-D, and this can be displaced upon addition of histone H1. A direct physical interaction between HMG-D and histone H1 was observed in a Far Western analysis. The competitive nature of this interaction is reminiscent of the apparent replacement of HMG-D by H1 during mid-blastula transition. These data are consistent with the hypothesis that HMG-D functions as a specialized linker protein prior to appearance of histone H1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,156
Score d'incertitude au seuil0,489

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetGenomics and Chromatin DynamicsTravaux en français237 207