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Enregistrement W2045901385 · doi:10.1002/bit.10312

Self‐activating factor X derivative fused to the C‐terminus of a cellulose‐binding module: Production and properties

2002· article· en· W2045901385 sur OpenAlexaff
Emily Kwan, M. Marta Guarna, A.B. Boraston, Neil R. Gilkes, Charles A. Haynes, Douglas G. Kilburn, R. Antony J. Warren

Notice bibliographique

RevueBiotechnology and Bioengineering · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeptideChemistryDerivative (finance)CelluloseCleavage (geology)HydrolysisSubstrate (aquarium)Carbohydrate-binding moduleC-terminusBiochemistryStereochemistryCombinatorial chemistryMaterials scienceAmino acidBiologyCellulase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this work, a new derivative of FX was engineered. It comprises a cellulose-binding module (CBM) fused to the N-terminus of the truncated light chain (E2FX) of FX and a hexahistidine tag (H6) fused to the C-terminus of the heavy chain. The sequence LTR at the site of cleavage of the activation peptide from the N-terminus of the heavy chain is changed to IEGR to render the derivative self-activating. However, N-linked glycans on the CBM of the derivative blocked its binding to cellulose and those on the activation peptide slowed its activation. Therefore, the sites of N-linked glycosylation on the CBM and on the activation peptide were eliminated by mutation. The final derivative can be produced in good yield by cultured mammalian cells. It is purified easily with Ni(2+)-agarose, it is self-activating, and it can be immobilized on cellulose. When immobilized on a column of cellulose beads, the activated derivative retains approximately 80% of its initial activity after 30 days of continuous hydrolysis of a fusion protein substrate. Under these conditions of operation, the effective substrate:enzyme ratio is >10(4).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,300

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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