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Enregistrement W2045919114 · doi:10.1042/bj20031150

Inhibition of hydroxyapatite formation by osteopontin phosphopeptides

2004· article· en· W2045919114 sur OpenAlexaff
David A. Pampena, Karen A. Robertson, Olga Litvinova, Gilles Lajoie, Harvey A. Goldberg, Graeme K. Hunter

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health ResearchWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOsteopontinChemistryPhosphorylationPhosphoserineIn vitroPeptidePhosphateBiological activityBiochemistryBiophysicsBiologySerineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osteopontin (OPN) is an acidic phosphoglycoprotein that is believed to function in the prevention of soft tissue calcification. In vitro studies have shown that OPN can inhibit the formation of hydroxyapatite (HA) and other biologically relevant crystal phases, and that this inhibitory activity requires phosphorylation of the protein; however, it is not known which phosphorylated residues are involved. We have synthesized peptides corresponding to four phosphoserine-containing sequences in rat OPN: OPN7-17, containing phosphoserines 10 and 11; OPN41-52, containing phosphoserines 46 and 47; OPN248-264, containing phosphoserines 250, 257 and 262; and OPN290-301, containing phosphoserines 295-297. The abilities of these peptides to inhibit de novo HA formation were determined using a constant-composition autotitration assay. All four OPN phosphopeptides caused a dose-dependent increase in nucleation lag time, but did not significantly affect subsequent formation of the crystals. However, OPN41-52 (inhibitory constant 73.5 min/microM) and OPN290-301 (72.2 min/microM) were approx. 4 times more potent inhibitors than OPN7-17 (19.7 min/microM) and OPN247-264 (16.3 min/microM). 'Scrambling' the amino acid sequence of OPN290-301 resulted in decreased potency (45.6 min/microM), whereas omission of the phosphate groups from this peptide caused a greater decrease (5.20 min/microM). These findings have identified phosphorylated sequences that are important for the ability of rat bone OPN to inhibit HA crystal formation, and suggest that negative-charge density is an important factor in this activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations145
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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