Inhibition of hydroxyapatite formation by osteopontin phosphopeptides
Notice bibliographique
Résumé
Osteopontin (OPN) is an acidic phosphoglycoprotein that is believed to function in the prevention of soft tissue calcification. In vitro studies have shown that OPN can inhibit the formation of hydroxyapatite (HA) and other biologically relevant crystal phases, and that this inhibitory activity requires phosphorylation of the protein; however, it is not known which phosphorylated residues are involved. We have synthesized peptides corresponding to four phosphoserine-containing sequences in rat OPN: OPN7-17, containing phosphoserines 10 and 11; OPN41-52, containing phosphoserines 46 and 47; OPN248-264, containing phosphoserines 250, 257 and 262; and OPN290-301, containing phosphoserines 295-297. The abilities of these peptides to inhibit de novo HA formation were determined using a constant-composition autotitration assay. All four OPN phosphopeptides caused a dose-dependent increase in nucleation lag time, but did not significantly affect subsequent formation of the crystals. However, OPN41-52 (inhibitory constant 73.5 min/microM) and OPN290-301 (72.2 min/microM) were approx. 4 times more potent inhibitors than OPN7-17 (19.7 min/microM) and OPN247-264 (16.3 min/microM). 'Scrambling' the amino acid sequence of OPN290-301 resulted in decreased potency (45.6 min/microM), whereas omission of the phosphate groups from this peptide caused a greater decrease (5.20 min/microM). These findings have identified phosphorylated sequences that are important for the ability of rat bone OPN to inhibit HA crystal formation, and suggest that negative-charge density is an important factor in this activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».