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Enregistrement W2045954665 · doi:10.1002/ajmg.a.31399

Mutation analysis of the <i>FRAS1</i> gene demonstrates new mutations in a propositus with Fraser syndrome

2006· article· en· W2045954665 sur OpenAlexaffabout
Anne Slavotinek, Chumei Li, Elliott H. Sherr, Albert E. Chudley

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueOcular Disorders and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Center for Research Resources
Mots-clésSyndactylyGeneticsFrameshift mutationExonBiologyMutationPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fraser syndrome (OMIM 219000) is a rare, autosomal recessive condition with classical features of cryptophthalmos, syndactyly, ambiguous genitalia, laryngeal, and genitourinary malformations, oral clefting and mental retardation. Mutations causing loss of function of the FRAS1 gene have been demonstrated in five patients with Fraser syndrome. However, no phenotype-genotype correlation was established and there was evidence for genetic heterogeneity. Fraser syndrome is rare and the FRAS1 gene has 75 exons, complicating mutation screening in affected patients. We have screened two patients who fulfilled the diagnostic criteria for Fraser syndrome and three patients with related phenotypes (two patients with Manitoba oculotrichoanal syndrome and one patient with unilateral cryptophthalmos and labial fusion) for mutations in FRAS1 to increase the molecular genetic data in patients with Fraser syndrome and related conditions. We report two new mutations in a patient with Fraser syndrome, a frameshift mutation and a deletion of two amino acids that we consider pathogenic as both alter the NG2-like domain of the protein. Although we are still unable to clarify a phenotype-genotype relationship in Fraser syndrome, our data add to the list of mutations associated with this syndrome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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