MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2045968501 · doi:10.1074/jbc.m112.392910

Dbf4 and Cdc7 Proteins Promote DNA Replication through Interactions with Distinct Mcm2–7 Protein Subunits

2013· article· en· W2045968501 sur OpenAlexaff
Matthew D. Ramer, Evelyin S. Suman, Hagen Richter, Karen Stanger, Martina Spranger, Nicole Bieberstein, Bernard P. Duncker

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA replicationBiologyOrigin recognition complexMinichromosome maintenanceMutantCell biologyProtein subunitImmunoprecipitationPre-replication complexDocking (animal)HelicaseS phaseKinaseCell cycleOrigin of replicationGeneticsDNAEukaryotic DNA replicationCellCell cultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The essential cell cycle target of the Dbf4/Cdc7 kinase (DDK) is the Mcm2-7 helicase complex. Although Mcm4 has been identified as the critical DDK phosphorylation target for DNA replication, it is not well understood which of the six Mcm2-7 subunits actually mediate(s) docking of this kinase complex. We systematically examined the interaction between each Mcm2-7 subunit with Dbf4 and Cdc7 through two-hybrid and co-immunoprecipitation analyses. Strikingly different binding patterns were observed, as Dbf4 interacted most strongly with Mcm2, whereas Cdc7 displayed association with both Mcm4 and Mcm5. We identified an N-terminal Mcm2 region required for interaction with Dbf4. Cells expressing either an Mcm2 mutant lacking this docking domain (Mcm2ΔDDD) or an Mcm4 mutant lacking a previously identified DDK docking domain (Mcm4ΔDDD) displayed modest DNA replication and growth defects. In contrast, combining these two mutations resulted in synthetic lethality, suggesting that Mcm2 and Mcm4 play overlapping roles in the association of DDK with MCM rings at replication origins. Consistent with this model, growth inhibition could be induced in Mcm4ΔDDD cells through Mcm2 overexpression as a means of titrating the Dbf4-MCM ring interaction. This growth inhibition was exacerbated by exposing the cells to either hydroxyurea or methyl methanesulfonate, lending support for a DDK role in stabilizing or restarting replication forks under S phase checkpoint conditions. Finally, constitutive overexpression of each individual MCM subunit was examined, and genotoxic sensitivity was found to be specific to Mcm2 or Mcm4 overexpression, further pointing to the importance of the DDK-MCM ring interaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,462

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetDNA Repair MechanismsTravaux en français237 207