Role of APAF‐1, E‐cadherin and peritumoural lymphocytic infiltration in tumour budding in colorectal cancer
Notice bibliographique
Résumé
Tumour budding or dedifferentiation at the invasive margin of colorectal cancer (CRC) is an important prognostic marker and linked mechanistically to dysregulation of Wnt pathway signalling. Since budding is observed in only 40% of CRCs, we hypothesized that Wnt pathway dysregulation may be a necessary but insufficient explanation for budding and that buds may be destroyed selectively by tumour immune mechanisms. Twenty potential markers of tumour budding were evaluated in tissue microarrays (TMAs) obtained from the main tumour body of 1164 DNA mismatch repair-proficient CRCs and the findings were correlated with tumour budding, lymphocytic infiltration and survival. Loss of expression of E-cadherin and APAF-1 were independent predictors of budding (sensitivity 70.3% and specificity 48.2% when one or the other was lost). Peritumoral lymphocytes (PTLs) were observed more frequently in CRCs with loss of either E-cadherin or APAF-1 that were budding-negative. PTLs and tumour-infiltrating lymphocytes (TILs) were strongly correlated. The absence of TILs increased the adverse prognostic impact of E-cadherin and APAF-1 loss. Co-occurrence of E-cadherin loss, APAF-1 loss and low TIL counts in CRCs was an independent prognostic factor. The findings were verified in whole tissue sections from 88 CRCs with known KRAS mutation status (which was not associated with budding). Loss of E-cadherin and APAF-1 within the main body of CRCs are independent predictors of tumour budding. The prognostic benefit of lymphocytic infiltration may be explained by the immune destruction of budding cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».