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Enregistrement W2046092378 · doi:10.1080/10425170600931601

Molecular characterization of α-gliadin genes from wild emmer wheat (<i>Triticum dicoccoides</i>)

2006· article· en· W2046092378 sur OpenAlexfundno aff
Pengfei Qi, Yuan-Wen Yue, Hai Long, Yuming Wei, Zehong Yan, Youliang Zheng

Notice bibliographique

RevueDNA sequence · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPseudogeneBiologyGeneticsGeneIntronGenBankStop codonExonIndelSequence analysisgenomic DNACoding regionGenomeGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

According to the two distal and conserved regions of known alpha-gliadin genes, gene-specific primers for alpha-gliadin were designed, and the coding regions of four gliadin genes (i.e. GliTd-1, GliTd-2, GliTd-3 and GliTd-4) with the length of about 800 bp were isolated from the genomic DNA of wild emmer wheat (Triticum dicoccoides). No introns were observed. Sequence comparison indicated that these genes should be classified as alpha-gliadins. GliTd-3 (GenBank accession No.DQ140351) and GliTd-4 (DQ140352) were potentially functional, whereas GliTd-1 (DQ140349) and GliTd-2 (DQ140350) were both pseudogenes by the definition of in-frame stop codons and frameshifts. Six conserved cysteine residues were observed. Sequence analysis suggested that the motif units of repetitive domain for the four newly detected genes were different from the known genes, and the QQQP sequence before the position 60 was more toxic to coeliac patients. Codons for proline were strongly biased. Codons (CAG and CAA) for glutamine were clustered into the specific regions, and the high percentage of pseudogenes resulted from the mutation of CAG --> TAG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,133
Score d'incertitude au seuil0,200

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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