Are the Linnean and Phylogenetic Nomenclatural Systems Combinable? Recommendations for Biological Nomenclature
Notice bibliographique
Résumé
A combination approach between the rules and recommendations from the Linnean (rank-based) and phylogenetic nomenclature is proposed, with a review of the debate. Advantages and drawbacks of both systems are discussed. Too often the debates are biased and unconstructive, and there is a need for dialogue and compromise. Our recommendations for the future of biological classification, to be considered by new editions of all codes of nomenclature, would enable the Linnean and the phylogenetic nomenclatural systems to coexist, or be combined. (1) We see it as essential that species binomen, including the formal rank of genus, are retained, and (2) species should continue to be linked to type specimens. (3) The use of other formal ranks should be minimized; however, we suggest retaining the classical supergeneric ranks (family, class, order, phylum, kingdom) for purely practical reasons. (4) For these ranks and any formally defined clades, type taxa (species, genera) should be replaced by phylogenetic definitions that explicitly hypothesize monophyly. (5) In contrast, species monophyly should not be required, because theory predicts that many species are not monophyletic. (6) It should be stressed that equal ranks do not imply comparable evolutionary histories.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,125 | 0,214 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,004 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,005 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,015 | 0,016 |
| Études des sciences et des technologies | 0,009 | 0,031 |
| Communication savante | 0,018 | 0,045 |
| Science ouverte | 0,017 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,013 | 0,020 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,012 | 0,012 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».