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Enregistrement W2046241020 · doi:10.1074/jbc.m114.576975

Amino Acid Derivatives as Bitter Taste Receptor (T2R) Blockers

2014· article· en· W2046241020 sur OpenAlex
Sai P. Pydi, Tyler Sobotkiewicz, Rohini Billakanti, Rajinder P. Bhullar, Michèle C. Loewen, Prashen Chelikani

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueBiochemical Analysis and Sensing Techniques
Établissements canadiensSaskatchewan Research Council (Canada)University of ManitobaChildren's Hospital Research Institute of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInverse agonistAgonistChemistryAmino acidTransmembrane domainAntagonistBiochemistryBinding siteReceptorStereochemistryPharmacologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In humans, the 25 bitter taste receptors (T2Rs) are activated by hundreds of structurally diverse bitter compounds. However, only five antagonists or bitter blockers are known. In this study, using molecular modeling guided site-directed mutagenesis, we elucidated the ligand-binding pocket of T2R4. We found seven amino acids located in the extracellular side of transmembrane 3 (TM3), TM4, extracellular loop 2 (ECL2), and ECL3 to be involved in T2R4 binding to its agonist quinine. ECL2 residues Asn-173 and Thr-174 are essential for quinine binding. Guided by a molecular model of T2R4, a number of amino acid derivatives were screened for their ability to bind to T2R4. These predictions were tested by calcium imaging assays that led to identification of γ-aminobutryic acid (GABA) and Nα,Nα-bis(carboxymethyl)-L-lysine (BCML) as competitive inhibitors of quinine-activated T2R4 with an IC50 of 3.2 ± 0.3 μM and 59 ± 18 nM, respectively. Interestingly, pharmacological characterization using a constitutively active mutant of T2R4 reveals that GABA acts as an antagonist, whereas BCML acts as an inverse agonist on T2R4. Site-directed mutagenesis confirms that the two novel bitter blockers share the same orthosteric site as the agonist quinine. The signature residues Ala-90 and Lys-270 play important roles in interacting with BCML and GABA, respectively. This is the first report to characterize a T2R endogenous antagonist and an inverse agonist. The novel bitter blockers will facilitate physiological studies focused on understanding the roles of T2Rs in extraoral tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,463

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle