Pollen contamination and mating patterns in a Douglas-fir seed orchard as measured by simple sequence repeat markers
Notice bibliographique
Résumé
Pollen contamination is detrimental to the genetic quality of seed orchard crops. Highly variable simple sequence repeat (SSR) markers make it possible to accurately measure pollen contamination and characterize patterns of within-orchard mating by directly identifying the male and female parent of each seed produced in the orchard. We used nine SSR markers to measure pollen contamination and characterize mating patterns based on seed samples collected in 3 years (1999, 2000, and 2003) from one block of a nonisolated, open-pollinated, clonal seed orchard of Douglas-fir (Pseudotsuga menziesii (Mirb.) Franco) in western Oregon. Pollen contamination was consistently high across the 3 years (mean = 35.3%, range = 31.0%-41.3%) and appeared to result primarily from cross-pollination among the orchard blocks. Levels of pollen contamination varied substantially among clones and were higher in clones with early female receptivity (mean = 55.5%) than in those with either mid (mean = 36.4%) or late (mean = 28.3%) female receptivity. We detected low rates of self-pollination (mean = 1.8% per clone) and over 10-fold differences in the relative paternal contributions of the clones. There was a clear pattern of positive assortative mating with respect to floral phenology. This study illustrates that SSR markers are powerful tools for characterizing seed lots and improving the design and management of Douglas-fir seed orchards.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».