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Enregistrement W2046407162 · doi:10.1139/w11-016

Genetic diversity and population structure of <i>Clavibacter michiganensis</i> subsp. <i>nebraskensis</i>

2011· article· en· W2046407162 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClavibacter michiganensisBiologyAmplified fragment length polymorphismGenetic diversityStrain (injury)PopulationGeneticsMicrobiologyBacteriaVeterinary medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis (CMN) is a gram-positive bacterium and an incitant of Goss's bacterial wilt and leaf blight or "leaf freckles" in corn. A population structure of a wide temporal and geographic collection of CMN strains (n = 131), originating between 1969 and 2009, was determined using amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis and repetitive DNA sequence-based BOX-PCR. Analysis of the composite data set of AFLP and BOX-PCR fingerprints revealed two groups with a 60% cutoff similarity: a major group A (n = 118 strains) and a minor group B (n = 13 strains). The clustering in both groups was not correlated with strain pathogenicity. Group A contained two clusters, A1 (n = 78) and A2 (n = 40), with a linkage of 75%. Group A strains did not show any correlation with historical, geographical, morphological, or physiological properties of the strains. Group B was very heterogeneous and eight out of nine clusters were represented by a single strain. The mean similarity between clusters in group B varied from 13% to 63%. All strains in group B were isolated after 1999. The percentage of group B strains among all strains isolated after 1999 (n = 69) was 18.8%. Implications of the findings are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,615
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,155
Écart entre enseignants0,141 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle