P04-03. Cross-clade neutralization analysis of plasmas from clade B, C and CRF01_AE HIV-infected donors
Notice bibliographique
Résumé
The genetic diversity of HIV-1, particularly in Env, is considered a major challenge for vaccine researchers, especially those attempting to elicit broadly neutralizing antibodies. Categorizing HIV strains into neutralization serotypes may help determine the requirements for maximal vaccine immune coverage. HIV is divided into clades, based on genetic relatedness, principally in Env. Investigations as to whether these clades might help to define neutralizing serotypes have so far mostly been confined to small studies, and have been hampered by the challenges of traditional PBMC-blast neutralization assays. The observation that some HIV+ plasmas neutralize viruses from several major clades hints of an undercurrent of conserved neutralization, but its potency relative to any clade-restricted activity is unknown. High throughput pseudovirus neutralization assays provide a way to investigate. Here, we measured neutralization of 45 primary viruses from clades B, C and CRF_01 AE by 12 broad plasmas from the same 3 clades. Significant cross-neutralization was observed, and well-defined neutralizing serotypes was absent. However, each plasma exhibited a unique pattern against the spectrum of viruses. Increased intraclade neutralization titers was observed in many cases. These were most pronounced for clade B-E viruses that were neutralized 2–10 fold more potently by clade-matched plasmas in several cases. We also investigated binding serotypes by gp120 ELISA, where we observed greater intraclade binding titers for B-E plasmas, mirroring the intraclade neutralization. Mapping analyses suggested that in some cases, the cross-neutralizing activity is mostly directed to gp120 and overlaps the CD4 binding site. The generally broad neutralization observed suggests that an immunogen based on one or a few Envs could, in principle, provide worldwide HIV-1 protection. Clade C Envs may be worth special attention, considering the particularly broad plasma neutralizing activities. The challenge remains to better define the cross-neutralizing specificities and moreover, to find immunogens able to induce them.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».